A saját fejlesztésű mód körül igen nagy vita vette kezdetét az állítólagosan benne lévő kártevőről.
Ha egy felhasználó a Geforce kártyája mellé berak egy Radeon-t is, akkor az előbbi megtagadja a munkát PhysX alatt. Erről az NVIDIA gondoskodott a hivatalos illesztőprogramjával, ugyanis az a minőségre és stabilitásra hivatkozva letiltja a PhysX használatát az adott zöld kártyán ha egy vörös ül mellette.
Létezik azonban egy mód, ami feloldja ezt a korlátot és úgy hívják, hogy Hybrid PhysX-Mod. E csomag körül robbant ki egy érdekes vita az interneten.
A történet arról szól, hogy állítólag a mód egy trójait tartalmaz „Infostealer.Gamepass” néven, amely híres játékok regisztrációs kulcsát lopja el, így juttatva azt el a fekete piacra. Ezt a trójait azonban számos antivírus megoldással nem sikerült kimutatni és az is ismeretes, hogy a PhysX-Mod korábbi verziói is hamis riasztást eredményeztek néhány vírusirtónál. Annak ellenére, hogy nem sikerült bebizonyítani a trójai meglétét a csomagban, a HardOPC vezetője, Kyle Benett még a mód fejlesztőjének nevének használatát is megtiltotta a fórumán.
Természetesen a fejlesztő, NGOHQ reagált a történtekre és teljes mértékben cáfolja az állítottakat. E bejegyzés szerint a csomag többször is le lett ellenőrizve, minden sorát átnézték és nem találtak benne kártékony kódot. A weboldalon lejárató kampánynak nevezik a történteket, amiben a Guru3D-t is félrevezetéssel vádolják.
A Hybrid PhysX-Mod az 1.03-as verzióba lépett, így már tomagatja a 197.45-ös jelzésű Geforce illesztőprogramot illetve a 9.10.0222 verziószámú PhysX Software-t. Azt, hogy a mód működik-e Fermi alapú kártyákkal, még a fejlesztők sem tudják. A csomag Windows XP és Windows 7 támogatást nyújt, a Vista felhasználók kimaradnak.
